• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   DSpace Ana Sayfası
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
  •   DSpace Ana Sayfası
  • Araştırma Çıktıları | TR-Dizin | WoS | Scopus | PubMed
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Two distinct events, section compression and loss of particles ("lost caps"), contribute to z-axis distortion and bias in optical disector counting

Tarih

2006

Yazar

Baryshnikova, Larisa M.
von Bohlen und Halbach, Oliver
Kaplan, Süleyman
von Bartheld, Christopher S.

Üst veri

Tüm öğe kaydını göster

Özet

Deformation of tissue sections in the z-axis can bias optical disector counting. When samples of particle densities are not representative for the entire tissue section, significant bias of estimated numbers can result. To assess the occurrence, prevalence, extent, sequence of events, and causes of z-axis distortion, the distribution of neuronal nucleoli in thick paraffin and vibratome sections was determined in chicken, rodent, and human brain tissues. When positions of neuronal nucleoli were measured in the z-axis, nucleoli were more frequent at the surfaces (bottom and top) of tissue sections than in the core. This nonlinear z-axis distribution was not lab-, equipment-, or investigator-specific, and was independent of age, fixation quality, coverslipping medium, or paraffin melting temperature, but in paraffin sections, was highly correlated with the tilt of the knife (cutting) angle. Manipulation of subsequent tissue processing steps revealed that two events contribute to z-axis distortion. Initially, a higher density of particles results at surfaces after sectioning, apparently due to section compression. Subsequently, particles can be lost to varying degrees from surfaces during floating or staining and dehydration, resulting in "lost caps." These results may explain different degrees of z-axis distortion between different types of sections and different labs, and reinforce the importance of checking z-axis distributions as a "quality control" prior to selection of guard zones in optical disector counting. Indirect approaches to assess section quality, such as resectioning in a perpendicular plane, yield additional artifacts, and should be replaced by a direct quantitative measurement of z-axis distribution of particles.

Kaynak

Microscopy Research and Technique

Cilt

69

Sayı

9

Bağlantı

https://doi.org/10.1002/jemt.20345
https://hdl.handle.net/20.500.12712/20471

Koleksiyonlar

  • PubMed İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [6144]
  • Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [14046]
  • WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu [12971]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 




| Politika | Rehber | İletişim |

DSpace@Ondokuz Mayıs

by OpenAIRE

Gelişmiş Arama

sherpa/romeo

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına Göre

Hesabım

GirişKayıt

İstatistikler

Google Analitik İstatistiklerini Görüntüle

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Politika || Kütüphane || Ondokuz Mayıs Üniversitesi || OAI-PMH ||

Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Samsun, Türkiye
İçerikte herhangi bir hata görürseniz, lütfen bildiriniz:

Creative Commons License
Ondokuz Mayıs Üniversitesi Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@Ondokuz Mayıs:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.