Nötrofilik-mezofilik streptomyces'lerin nümerik sınıflandırılması / İlknur Yalçın (Yılmaz).

Abstract

Actinomycetesler önemli biyoaktif bileşikler , antibiyotikler , enzimler , enzim inhibitörleri ve vitaminlerin başllıca kaynağıdır. Özellikle elde edilen 7000'den fazla antibiyotiğin %60'ı şüphesiz bu organizmalar tarafından üretilmektedir. Streptomyces griseus tarafından "streptomisin" antibiyotiğinin keşfi ile birlikte modern antibiyotik devri başlamış ve daha sonra yeni biyoaktif bileşikler için sayılamıyacak kadar Streptomyces farklı ortamlardan izole edilerek korunmuştur. Ülkemizde Streptomyces'ler ilgili kapsamlı bir çalışma yapılmamıştır. Bu çalışmada ülkemizdeki yedi coğrafik bölgeden sekiz ilden toprak örnekleri alındı. Toprak örneklerinin alındığı iller ve lokaliteleri : Adana;bahçe , Artvin;çay bahçesi , Erzurum;dere kenarı , Gaziantep;bahçe , İstanbul;botanik bahçesi , Manisa;kayalık açık alan , Nevşehir;bahçe , Samsun;bahçe toprağı olmak üzeredir. Toprak örneklerindeki organizmalar karıştırma ve sulandırma yöntemleriyle seyreltildi. Her bir sulandırma için üç petri hazırlanarak bu sulandırmalardan kurutulmuş besiyeri üzerine transfer edilerek 25°C de iki hafta inkübe edildi. Saf kültür haline getirilmiş 300 organizma renk gruplarını tespit etmek için Oatmeal besiyeri üzerine transfer edildi. İzolasyon plaklarından saflaştırılan 300 streptomycetes; beş büyük (7-12 suş) sekiz küçük (2-4 suş) ve dört tek üyeden oluşan renk grubuna ayrılmıştır. Bu gruplar arasından seçilen 62 test organizmasıyla test setleri oluşturuldu. 62 test organizmasından 14 organizma duplikat suş olarak seçildi. Duplikat kültürler test hatasının hesaplanması duplikat kültürler arasındaki yüzde uyum oranlarının ve test varyansının belirlenmesi için kullanıldı . Nümerik analizlerinin yapılabilmesi için 62 test suşu, 14 duplikat suş ve 12 tip örneği 87 birim karakteri içeren besin, degradasyon, fizyolojik,morfolojik ve pigmentasyon testlerine tabi tutuldu. Test sonuçlarının değerlendirilmesi için Ssm,UPGMA analizi kullanıldı. Ssm UPGMA analizinin temel alındığı sınıflandırma uyumlu grupların ve kümelerin iyi bir şekilde dağılmasına imkan verdiğinden bu analiz yüksek bir kophenetik korelasyon değeri vermektedir. Ssm katsayısına göre Streptomyces türleri arasında %77 oranında bir benzerlik derecesi belirlendi. Bu benzerlik derecesine göre test organizmaları ve tip örnekleri;beş büyük (5-6 suş) ondört küçük (2-4 suş) ve dört tek üyeli (SMC) grubuna ayrılmıştır.