Termofilik streptomyces'lerin izolasyonu ve nümerik taksonomisi / Erman Öztürk; Danışman Nevzat Şahin.

Abstract

Termofilik streptomyces’lerin mikrobiyal teknolojideki potansiyel önemlerine rağmen taksonomistlerce pek fazla önemsenmemiştir.Literatürlerde konu ile ilgili birkaç çalışma olmasına rağmen ülkemizde herhangi bir çalışmaya rastlanılmamıştır.Bu çalışmada ,4 farklı toprak tipinde termofilik streptomyces’ler izole edilmiştir.Toprak örneklerinin alındığı iller ve lokaliteleri: Adana;at gübreli toprak ,Adana ;pamuk kozası atığı,Samsun;bahçe toprağı , Samsun;koyun gübreli toprak oluşturmaktadır.Toprak örnekleri dilusyon plak yöntemiyle seyreltilmiştir.Her bir sulandırmadan , cycloheximide (50ug ml¹) ve rifampicin (0.5 ug ml¹) ilaveli kuru nişasta-kazein agar üzerine 0.2 ml toprak solusyonu transfer edilerek 55°C 'de 7 gün süreyle inkübe edilmiştir. Saf kültür haline getirilmiş 77 izolat,renk gruplarının belirlenmesi için, oatmeal agar ve inorganik salts-starch agar üzerine transfer edildi.Bunlardan seçilen 45 test izolatı, oatmeal agar üzerinde 4 büyük (5-8suş),5 küçük (2-4 suş)ve 2 tek üyeli kümeden oluşan 11 renk grubuna ayrılırken ,inorganik salts-starch agar üzerine 5 büyük ( 6-10suş ),2 küçük (2-4 suş) kümeden oluşan 7 renk grubuna ayrılmıştır. Nümerik analizler için 45 test izolatı ,8 tip örneği, 29 referans suş ve bunlardan rasgele seçilmiş 16 duplike suş’dan oluşan 98 test organizmasına 163 birim karakter içeren besinsel ,biyokimyasal, degredasyon, fizyolojik ,morfolojik ve pigmentasyon testleri uygulanmıştır.Elde edilen test sonuçları TAXON programında , Ssm, COMPLETE analizi ile değerlendirilmiştir.Ssm, COMPLETE analizi , uyumlu grupların ve kümelerin %82.5 oranında yüksek benzerlik değeriyle dağılmasına imkan vermiştir.82 suş;7 büyük ( 5-8suş ), 9 büyük ( 2-4 suş )ve 10 tek üyeli kümeye ayrılmıştır.