Bazı organik bileşiklerin kristalografik ve kuantum mekaniksel yöntemlerle yapısal karakterizasyonu / Yavuz Köysal ; Danışman Şamil Işık.

Abstract

Bu tez çalışmasında adı geçen molekül yapıları, tek kristal X-ışınları kırınım yöntemiyle çözülmüştür. Söz konusu kristallerin kırınım verileri Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fizik Bölümü, X-ışınları laboratuarında mevcut olan STOE IPDS II difraktometresinden elde edilmiştir. İncelenen, 3-[(5-Methyl-2-benzoxazolinone-3-yl)methyl]-4-ethyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione, (C13H16N4O3S), 4-Allyl-3-[(5-methyl-2-oxo-1,3-benzoxazol-3-yl)methyl]-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione, (C14H14N4O2S), 3-[(5-methyl-2-benzoxazolinone-3-yl)methyl]-4-phenyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione,(C17H14N4O2S), 3-Phenyl-5-(2-thienyl)-2-pyrazoline-1-thioamide, (C14H13N3S2), 1-Thiocarbamoyl-3,5-di(2-thienyl)-2-pyrazoline, (C12H11N3S3), molekülleri Hacettepe Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Kimya laboratuarında kristallendirilmişlerdir. Bu tez çalışmasında incelenen, (C13H16N4O3S), (C14H14N4O2S), (C17H14N4O2S), (C14H13N3S2), (C12H11N3S3) kristallerinden elde edilen X-ışını kırınım verileri, direkt yöntemler metodu ile çözülmüş ve model yapılar elde edilmiştir. Çözümü sağlanan kristallere en küçük kareler metodu ve Fourier analizi uygulanarak arıtım işlemleri tamamlanıp yapı analizi sonuçlandırılmıştır. Yapı analizleri tamamlanan kristaller ayrıca kuramsal olarak incelenmiştir. Bu amaçla kuantum mekaniği içinde yer alan yarı deneysel metotlara ait olan AM1 ve PM3 yöntemleri kullanılmıştır. Bu iki yöntemden AM1 yönteminin incelenen kristal yapıları için daha iyi sonuçlar verdiği tespit edilmiş ve hesaplamalar AM1 yöntemiyle yapılmıştır. Kuramsal çalışmalar kapsamında incelenen kristal yapıları için X-ışınları başlangıç geometrisi ve model başlangıç geometrilerinin her ikisi için potansiyel enerji yüzeyi analizleri (PES), moleküler dipol momentleri, elektrostatik eş potansiyel yüzeyleri (EPS) hesaplanmış ve karşılaştırılarak tartışılmıştır.