Streptomyces violaceusniger kümesi (clade) üyelerinin rizosferden izolasyonu ve karakterizasyonu / Meral Doğramacı; Danışman Nevzat Şahin.

Abstract

Bu çalışmada, ağaç ve çalı formundaki Acasia dealbata, Albizia distachya, Colutea arborescens, Gladitsia triancanthos, Medicago arborea, Sophora japonica, Spartium junceum, Tipuana tipu ve Wisteria sinensis baklagillerin rizosferinden, kök patojeni olan funguslara karşı antagonistik etkisi olduğu bilinen Streptomyces violaceusniger kümesi üyelerinin izolasyonu ve nümerik taksonomisi yapılmıştır.İzolasyonda dilüsyon plak tekniği uygulanmış olup cyloheximide (50 µg/ml), nystatin (50 µg/ml) ve rifampicin (0.5 µg/ml) ilaveli nişasta-kazein agar üzerine 0.2 ml toprak dilusyonu ilave edilen izolasyon plakları 25oC'de 14 gün inkübe edildi. Saf kültürleri yapılan ve oatmeal agar üzerine transfer edilen toplam 305 izolat, oatmeal agar üzerindeki pigmentasyon özelliklerine göre 22 büyük (5-49 suş), 12 küçük (2-4 suş) ve 9 tek üyeli kümeye ayrılmıştır. Streptomyces violaceusniger kümesi üyelerinin karakteristik pigmentasyon özelliklerini gösteren 35. ve 37. renk grupları üyeleri, melanin pigmenti üretip üretmediklerini belirlemek amacıyla pepton yeast-extract iron agar üzerine transfer edilmiş, bunlardan melanin pigmenti üretmeyen ve spor zincir morfolojisi spiral olan 75 izolat test organizması olarak belirlenmiştir. Nümerik analizler için 75 test izolatı, Streptomyces violaceusniger kümesi üyesi olan 7 tip örneği ve 6 duplike suştan oluşan toplam 88 test suşuna, besinsel, biyokimyasal, degredasyon ve fizyolojik testlerden oluşan toplam 94 test uygulanmıştır. Elde edilen test sonuçları, X-Taxon programında SSM-UPGMA analizleri ile değerlendirilmiştir. Son veri matriksine göre NTSys-pc programıyla yapılan analiz sonucu, % 85 benzerlik değeriyle 6 büyük (5-14 suş), 4 küçük (2-4 suş) ve 21 tek üyeli küme oluşmuştur.